Henri Pirenne var en belgisk historiker. Fra 1886 var han professor i Gent.

Pirenne spesialiserte seg i middelalderens historie og ga med verkene Les Villes du moyen âge (1927; norsk utgave Byene i middelalderen, 1968) og Mahomet et Charlemagne (1937) meget betydelige bidrag til forskningen på dette feltet. Han hevdet her at de germanske folkevandringene ikke brakte brudd i den sosiale og økonomiske utviklingen i Vest-Europa og Sør-Europa, noe derimot islams ekspansjon gjorde.

Han ga også ut Histoire de Belgique (7 bind, 1900–1932), hvor han argumenterer for at Belgia (Sør-Nederlandene) fra middelalderen av har dannet en politisk enhet.