Kongregasjon er en forsamling eller gruppe, særlig av religiøs art.

Ordet benyttes i flere betydninger i den katolske kirke:

• Samlebetegnelse for deltagerne i et kirkelig ritual.
• Betegnelse for deler av det pavelige byråkrati, for eksempel Troskongregasjonen, Congregatio de Doctrina Fidei.
• Samlebetegnelse for en sammenslutning av klostre innenfor et større ordenssamfunn. For eksempel rommer Benediktinerordenen blant annet en Maurinerkongregasjon med særegne skikker og arbeidsoppgaver.

I vanlig språkbruk benyttes ordet ofte synonymt med klosterorden, men en kongregasjon har en løsere organisasjon, det er ikke klostertvang (klausur), og kongregasjonen har utadrettet virksomhet i form av sykepleie, sosialt arbeid og så videre.