Territoritalsystem er et kirkerettslig system som går ut på at religionen til fyrsten avgjør hvilken religion innbyggerne i riket hans/hennes skal følge. Det uttrykkes ved den latinske formelen Cuius regio, eius religio (den som styrer, bestemmer religionen).

For Det tysk-romerske rikets vedkommende ble dette prinsippet fastslått ved den Augsburgske religionsfred i 1555, og det ble praktisert overalt i de landene med eneveldige konger.

Naturfilosofene på 1600-tallet hevdet at kongen ikke hadde noen åndelig myndighet (jus in sacris), men derimot en nesten total makt over kirken som korporasjon (jus circa sacra). Slik ble forholdet oppfattet blant annet i den dansk-norske Kongeloven.